肛交是有害健康的，所以是不应该提倡的。肛交最主要的危害就是可能造成肛门机械性损伤，进而导致出现肛裂的症状，比如说便血，肛门剧烈疼痛等，症状严重可明显影响日常的生活质量。
肛交还有可能造成肛门各种细菌的感染，是极不卫生的。此外，肛交还是传播常见各种性病的一个途径，像艾滋病、梅毒、肛周尖锐湿疣等疾病，都可以通过肛交来进行传播扩散。
